1937 - תחילת פעילותה של מעבדת מחקר, בראשותו של ד"ר ברוך לוין, אשר פיתח וייצר בה תרכיבי חיסון וטרינרים.
1948 - ד"ר לוין החל לייצר אנטיביוטיקה לייצוא. מעבדתו של ד"ר לוין פעלה כחלק מהאוניברסיטה העברית וייצרה תרכיבי חיסון לחיילי צה"ל. בתום המלחמה נותק הקשר עם האוניברסיטה העברית. חברת ב.ש. לוין הופכת למפעל עצמאי לייצור תרופות במרכז העיר ירושלים.
1949 - ד"ר לוין מקים את חברת הפרמצבטיקה "מעבדות רפא". החברה הייתה חלוצה בישראל בתחומי מחקר, ייצור ושיווק של חומרים מקבוצת הפניצילין, טירוטריצין וסטרפטומיצין, שחלקם נמצאים בשימוש עד היום.
1959 - בנו של ד"ר לוין, שמריהו לוין (1937-2006) מצטרף לחברה המשפחתית.
1973 - רפא מתחילה לשתף פעולה עם יצרנים בינ"ל, ביניהם, ד"ר פאלק, בורינגר אינגלהיים ועוד. ד"ר לוין פורש ממעבדות רפא וממנה את בנו, שמריהו לוין, למנכ"ל ויו"ר החברה. רפא מובילה את תחומי הטיפול במחלות מעי דלקתיות ובהפרעות שינה.
1985 - רפא הראשונה להשיק בישראל מורפיום בטבליות שחרור מבוקר (MCR) לטיפול בכאב, ועונה על צרכים שטרם נענו בתחום הכאב בארץ.
1990 - חברת מעבדות רפא החלה לפעול גם בתחום תרופות ללא מרשם (OTC).
2004 - לאחר 45 שנים בחברת מעבדות רפא מפנה שמריהו לוין את מקומו כמנכ"ל וממנה את ירון זקהיים למנכ"ל החברה.
2006 - לאחר פטירתו של שמריהו לוין, מונה ליו"ר רפא, בנו, אמיר לוין.
2011 - הנחת אבן הפינה למפעל החדש בהר החוצבים.
2013 - נפתח מפעל הייצור החדש
2018 - ירון זקהיים, מנכ"ל החברה נפטר ובמקומו מונתה ענת סביון כמנכ"ל החברה
2020 - אמיר לוין מונה למנכ"ל החברה
2024- עידו לשם מונה למנכ"ל החברה ואמיר לוין עבר לתפקיד סגן יו"ר החברה
